Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
HES3Q5TGS1 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms