Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NCAPHQ15003 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NCAPHQ15003 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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