Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1SQ13698 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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