Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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NAE1Q13564 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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NAE1Q13564 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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NAE1Q13564 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
NAE1Q13564 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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