Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
STRN3Q13033 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms