Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APOBRQ0VD83 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APOBRQ0VD83 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms