Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NOMO3P69849 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms