Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDAC4P56524 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HDAC4P56524 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms