Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIK1P39086 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms