Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOX11P35716 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SOX11P35716 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SOX11P35716 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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