Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NFKB1P19838 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NFKB1P19838 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NFKB1P19838 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms