Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BMP3P12645 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BMP3P12645 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BMP3P12645 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms