Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SPAG9O60271 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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