Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC78A2IDD5 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms