Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PNMA3Q9UL41 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms