Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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SH3BP4Q9P0V3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4Q9P0V3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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