Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PNPLA8Q9NP80 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms