Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms