Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TUBB2BQ9BVA1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms