Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BORCS6Q96GS4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms