Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM12Q96EX1 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms