Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BRMS1LQ5PSV4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BRMS1LQ5PSV4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms