Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CDO1Q16878 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CDO1Q16878 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDO1Q16878 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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