Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DDR2Q16832 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms