Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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APOFQ13790 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
APOFQ13790 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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