Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALCAMQ13740 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ALCAMQ13740 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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