Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
GRIK2Q13002 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.4 ms