Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms