Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDE4DQ08499 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms