Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MMP13P45452 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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