Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PBX2P40425 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PBX2P40425 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PBX2P40425 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PBX2P40425 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms