Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PPARGP37231 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PPARGP37231 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PPARGP37231 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PPARGP37231 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms