Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD13P35453 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD13P35453 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms