Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CYBBP04839 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms