Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C9orf172C9J069 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
C9orf172C9J069 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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