Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms