Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CTSFQ9UBX1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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