Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM31Q9BZY9 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms