Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RTKNQ9BST9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RTKNQ9BST9 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms