Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
WSCD1Q658N2 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms