Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HFEQ30201 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HFEQ30201 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HFEQ30201 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HFEQ30201 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HFEQ30201 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HFEQ30201 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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HFEQ30201 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
HFEQ30201 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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