Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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COL24A1Q17RW2 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
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COL24A1Q17RW2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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COL24A1Q17RW2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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COL24A1Q17RW2 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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COL24A1Q17RW2 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL24A1Q17RW2 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL24A1Q17RW2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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