Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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SSX1Q16384 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SSX1Q16384 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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