Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CNGA3Q16281 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNGA3Q16281 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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