Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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RAB35Q15286 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RAB35Q15286 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
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