Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PCM1Q15154 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms