Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CALD1Q05682 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CALD1Q05682 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms