Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CHRNEQ04844 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms