Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDK16Q00536 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms