Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2BQ00403 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms